हम अब एक वायरस उत्परिवर्तित देख सकते हैं जैसे पहले कभी नहीं

कोरोनवायरस के विकास को ट्रैक करना, पत्र द्वारा पत्र, महामारी विज्ञान में क्रांति ला रहा है।

गेट्टी / पॉल स्पेला / अटलांटिक

शुरुआत में एक था।

पहला जीनोम रहस्यमय बीमारी पैदा करने वाले वायरस के लिए हमने अभी तक COVID-19 का नाम नहीं रखा था वैज्ञानिकों द्वारा साझा 10 जनवरी, 2020 को। उस एकल जीनोम ने दुनिया को एक उपन्यास कोरोनावायरस के खतरे के प्रति सचेत किया। यह नए परीक्षणों का आधार था क्योंकि देशों ने अपनी सीमाओं के भीतर वायरस को खोजने के लिए हाथापाई की। और यह टीकों का खाका बन गया, वही अब हर दिन लाखों लोगों के लिए अपना रास्ता बना रहा है। हो सकता है कि पहला कोरोनावायरस जीनोम 2020 में प्रकाशित सबसे महत्वपूर्ण 30,000 पत्र रहा हो।

तब से, अनुक्रमित जीनोम की संख्या केवल 700,000 तक फट गई है। केवल एक साल में, COVID-19 का कारण बनने वाला वायरस अब तक का सबसे अनुक्रमित वायरस बन गया है - एचआईवी और इन्फ्लूएंजा जैसे लंबे समय से दावेदारों से आगे निकल रहा है। हर दिन दुनिया भर में हजारों कोरोनावायरस जीनोम अनुक्रमित होते हैं; आपके द्वारा इन तीन अनुच्छेदों को पढ़ने में लगने वाले मिनट में कई उत्पन्न हो गए थे। यूनिवर्सिटी कॉलेज लंदन के एक वायरोलॉजिस्ट जूडिथ ब्रेउर कहते हैं, यह एक क्रांति रही है।

इन्फ्रारेड सौना कितने गर्म होते हैं

पढ़ें: हमारी आंखों के सामने विकसित हो रहा है कोरोना वायरस

अब हम मानव इतिहास में पहली महामारी से गुजर रहे हैं जहां वैज्ञानिक वास्तविक समय में एक उपन्यास वायरस के विकास को ट्रैक करने के लिए और उस जानकारी पर निर्णायक रूप से कार्य करने के लिए तेजी से और उग्र रूप से अनुक्रमित कर सकते हैं। वायरस लगातार उत्परिवर्तन-आनुवांशिक टाइपो-प्राप्त करते हैं और कभी-कभी वे रुचि के एक प्रकार में उत्परिवर्तित होते हैं। यह अनुक्रमण था जिसने यूके में एक विशिष्ट और अधिक पारगम्य संस्करण की पहचान की। यह अनुक्रमण था जिसने प्रतिक्रिया में सख्त लॉकडाउन को प्रेरित किया। और अब यह अनुक्रमण है जो विभिन्न प्रकारों के प्रसार को ट्रैक कर रहा है, जिनमें पहले दक्षिण अफ्रीका और ब्राजील में पाए जाने वाले उत्परिवर्तन शामिल हैं कुंद प्रतिरक्षा टीकों और पिछले संक्रमणों से।

अनुक्रमण के बिना, हमने रहस्यमय नए उछाल या पुन: संक्रमण को देखा होगा, केवल बेतहाशा और पूर्वव्यापी रूप से अनुमान लगाने के लिए कि क्यों; अब वैज्ञानिक इन महामारी विज्ञान के रुझानों को कोरोनावायरस के आनुवंशिक कोड में अक्षर-दर-अक्षर परिवर्तनों का पता लगा सकते हैं - और इसे नीति को प्रभावित करने के लिए पर्याप्त तेजी से करते हैं, संभावित रूप से वेरिएंट को संभालने से पहले धीमा कर देते हैं। सकारात्मक COVID-19 परीक्षणों की इस व्यवस्थित अनुक्रमण को कहा जाता है जीनोमिक निगरानी।

जीनोमिक निगरानी के उदय ने वैज्ञानिकों को भी थोड़ा आश्चर्यचकित कर दिया है। यदि वे जानते थे कि संस्करण फ्रंट-पेज समाचार बन जाएंगे, तो वे बी.1.1.7, 20आई/501वाई.वी1 और वीओसी 202012/01 से बेहतर नामों के साथ आ सकते हैं, जो भ्रमित करने वाले हैं, एक ही यूके संस्करण के लिए सभी नाम . (कोई आश्चर्य नहीं कि जनता ने इसे यू.के. संस्करण कहना जारी रखा है, इसके बावजूद आधिकारिक चेतावनी भौगोलिक नामों से बचने के लिए।) WHO अभी चर्चा कर रहा है a नई संस्करण-नामकरण योजना . ऐसी कोई योजना मौजूद नहीं है, क्योंकि हमें पहले कभी भी सार्वजनिक रूप से वेरिएंट के बारे में बात नहीं करनी पड़ी- क्योंकि हमने पहले कभी भी ऐसे वेरिएंट की पहचान नहीं की थी, जो महामारी की प्रतिक्रिया के लिए पर्याप्त रूप से महत्वपूर्ण हों।

अस्पष्ट रूपांतर नाम एक छोटे, उदाहरण के लिए, चुनौतियों का उदाहरण हैं जो अकादमिक प्रयोगशालाओं से बाहर जीनोमिक निगरानी के साथ आते हैं और इसे सार्वजनिक स्वास्थ्य में डाल देते हैं। इन दिनों अनुक्रमण आसान है, वैज्ञानिकों ने मुझे बार-बार बताया। विश्लेषण कठिन है। और, कुछ उल्लेखनीय अपवादों के साथ, वायरल जीनोम में कुछ बदलते अक्षरों के आधार पर जनता को वास्तविक बलिदान करने के लिए राजी करना अभी भी कठिन है। महामारी ने जीनोमिक निगरानी की शक्ति दिखाई है, लेकिन इसे चलाने की चुनौतियों को भी उजागर किया है। भविष्य में, जब हमने COVID-19 के सबक सीखे हैं, तो बीमारियों की जीनोमिक निगरानी नियमित और नौकरशाही बन सकती है। यह महामारी की सबसे बड़ी वैज्ञानिक विरासत हो सकती है।

लेकिन इस बार, इस महामारी में, जीनोमिक निगरानी की सफलता मानव अंतर्ज्ञान और मानव दूरदर्शिता और एक सामयिक भाग्यशाली विराम पर निर्भर है।

यूके और दक्षिण अफ्रीका के वेरिएंट की खोजों की कहानी एक ऐसा ही उदाहरण है। पिछली सर्दियों में, दक्षिण अफ्रीका में क्वाज़ुलु-नताल विश्वविद्यालय के जैव सूचनाविद् ट्यूलियो डी ओलिवेरा ने चीन में रहस्यमय निमोनिया के मामलों का एक समूह देखना शुरू किया। और जब वह पहला वायरल जीनोम जनवरी में इंटरनेट पर आया, तो उसने दक्षिण अफ्रीका में कोरोनावायरस को अनुक्रमित करने के लिए अपनी प्रयोगशाला तैयार करना शुरू कर दिया।

डी ओलिवेरा दुनिया भर के वैज्ञानिकों के एक छोटे से कैडर में से एक थे, जिन्हें पहले से ही इस तरह की चीज़ों का महत्वपूर्ण अनुभव था। उन्होंने पहले जीका, डेंगू, चिकनगुनिया और पीले बुखार जैसे वायरस के जीनोम को अनुक्रमित किया था, जो दक्षिण अमेरिका में फैलते हैं। (डी ओलिवेरा मूल रूप से ब्राजील से हैं।) अन्य लोगों ने इन्फ्लूएंजा, इबोला, वेस्ट नाइल और लासा बुखार पर समान काम किया है। लेकिन अधिकांश भाग के लिए, ये अध्ययन छोटे और पूर्वव्यापी थे- और वे अकादमिक की इत्मीनान से गति से चले गए। जब तक परिणाम प्रकाशित हुए, तब तक प्रकोप आम तौर पर बहुत लंबा हो चुका था।

पढ़ें: कोरोनावायरस वेरिएंट के बीच परेशान करने वाला नया पैटर्न

मदेरणा के टीके में क्या है

यह नया कोरोनावायरस एक आपात स्थिति थी, और डी ओलिवेरा इससे आगे निकलना चाहता था। हफ्तों के भीतर, उनकी टीम ने नए वायरस के जीनोम को इकट्ठा करने के लिए सॉफ्टवेयर लिखना समाप्त कर दिया था, ब्राजील से सहयोगियों में लाया गया था, और हवाई यात्रा के बंद होने की प्रत्याशा में प्रयोगशाला रसायनों पर स्टॉक किया था। डी ओलिवेरा ने पूरे दक्षिण अफ्रीका में COVID-19 नमूनों की एक व्यवस्थित अनुक्रमण की कल्पना की। वहां पहुंचने के लिए, उन्हें सरकारी परीक्षण प्रयोगशालाओं से सकारात्मक COVID-19 नमूने एकत्र करने के लिए कानूनी और नैतिक अनुमति लेनी पड़ी। इन नमूनों को फिर अनुक्रमण के लिए पुन: संसाधित किया जाना था। विशिष्ट COVID-19 परीक्षण कोरोनवायरस के जीनोम के केवल कुछ स्निपेट को गति-पढ़ते हैं; अनुक्रमण का अर्थ है सभी 30,000 अक्षरों को पढ़ना।

पिछले साल मार्च तक, जब दक्षिण अफ्रीका में COVID-19 का प्रसार शुरू हुआ, तो डी ओलिवेरा की टीम जाने के लिए तैयार थी। शुरुआती दिनों में जीनोमिक निगरानी के लिए एक महत्वपूर्ण सवाल यह था कि देश में COVID-19 कैसे पहुंच गया था। तो वैज्ञानिकों ने इस्तेमाल किया जीनोम वायरस के रास्ते को फिर से बनाने के लिए: कोरोनावायरस कई बार पेश किया गया था, ज्यादातर यूरोप से। 2020 के दौरान, महामारी बढ़ गई और कम हो गई, और डी ओलिवेरा और उनके सहयोगियों ने अनुक्रम इकट्ठा करना जारी रखा।

नवंबर में, एक पूरी तरह से नया पैटर्न दिखाई दिया। दक्षिण अफ्रीका के पूर्वी केप में डॉक्टरों ने डी ओलिवेरा को बताया कि मामले फिर से बढ़ रहे थे, ऐसा लगता है कि कहीं से भी नहीं है। क्या वायरस बदल गया था? क्या यह उत्परिवर्तित हो सकता था? उनकी टीम एक सप्ताह के भीतर क्षेत्र के 50 क्लीनिकों से नमूनों का अनुक्रम करने के लिए तेजी से आगे बढ़ी, और उन्हें विविधता की आश्चर्यजनक कमी मिली। लगभग सभी समान उत्परिवर्तन के साथ, सभी 50 क्लीनिकों के नमूने निकट से संबंधित थे। वे एक प्रकार की तरह लग रहे थे। क्योंकि उसके पास पिछले सात महीनों का डेटा था, डी ओलिवेरा जानता था कि यह अजीब था; सामान्य तौर पर, अगर उसने 50 क्लीनिकों का नमूना लिया, तो उसे वायरस के 30 या 40 अलग-अलग संस्करण मिल सकते हैं। और क्योंकि उसके पास पूरे देश से डेटा था, वह देख सकता था कि यह संस्करण अब अन्य क्षेत्रों में रेंग रहा था। अनुक्रमण के उन सभी महीनों का भुगतान किया गया था, लेकिन खबर बुरी थी। वास्तव में वायरस बदल चुका था। और नया संस्करण ले रहा था।

दिसंबर की शुरुआत में, डी ओलिवेरा कुछ प्रारंभिक परिणाम साझा किए एक पुराने सहयोगी, एंड्रयू रामबाउट के साथ, जो नए वायरस के विकास में माहिर हैं। उन दोनों ने करीब 15 साल पहले ऑक्सफोर्ड में एक दूसरे को ओवरलैप किया था; रामबाउट अब एडिनबर्ग विश्वविद्यालय में है, यूके में डी ओलिवेरा ने एक विशेष उत्परिवर्तन को चिह्नित किया, जिसे N501Y कहा जाता है, जो स्पाइक प्रोटीन के एक प्रमुख क्षेत्र में बैठता है जो सीधे मानव कोशिकाओं से बांधता है।

ओलिविरा की नोक पर , रामबौत ने यूके में कोरोनोवायरस अनुक्रमों को खंगालना शुरू कर दिया, जिसका पूरी दुनिया में सबसे बड़ा और सबसे अच्छा वित्त पोषित जीनोमिक-निगरानी कार्यक्रम है। (डी ओलिवेरा ने वास्तव में इस पर दक्षिण अफ्रीका के निगरानी कार्यक्रम का मॉडल तैयार किया था। लेकिन, निश्चित रूप से, हमारे पास बहुत कम संसाधन हैं, उन्होंने कहा, इसलिए दक्षिण अफ्रीका केवल एक अंश का अनुक्रमण कर रहा था, जितने नमूने यूके थे।) छह हजार मील दूर, N501Y यूके के डेटाबेस में भी दिखाई दिया- केंट के अनुक्रमों में, जहां चल रहे लॉकडाउन के बावजूद मामले बढ़ रहे थे।

हफ्तों के भीतर, यू.के. ने घोषणा की अपने स्वयं के अधिक पारगम्य संस्करण की खोज, जो स्वतंत्र रूप से दक्षिण अफ्रीका संस्करण से उत्पन्न हुई थी। यह खबर पूरी दुनिया में गूंज उठी। यू.एस. सहित कई देश, यू.के. यात्रा को प्रतिबंधित करने के लिए ले जाया गया और अपनी सीमाओं के भीतर संस्करण की तलाश करें।

यूके में दुनिया में सबसे बड़ा COVID-19 अनुक्रमण कार्यक्रम है, कोई छोटा हिस्सा नहीं है क्योंकि इसमें पहले से ही इस क्षेत्र के कई शीर्ष विशेषज्ञ हैं। हम सभी ब्रिट्स के साथ काम करते हैं क्योंकि वे बहुत अच्छे हैं, सैन डिएगो में स्क्रिप्स रिसर्च के एक माइक्रोबायोलॉजिस्ट क्रिस्टियन एंडरसन कहते हैं। यूके ने अकेले ही इस कोरोनावायरस के लिए सभी जीनोम का एक तिहाई से अधिक उत्पन्न किया है, जिसे अकादमिक और सार्वजनिक प्रयोगशालाओं के एक संघ के लिए धन्यवाद कहा जाता है। COVID-19 जीनोमिक्स यूके , या सीओजी-यूके।

सीओजी-यूके का विचार कैम्ब्रिज विश्वविद्यालय के एक सूक्ष्म जीवविज्ञानी शेरोन पीकॉक के पास आया, क्योंकि पहली लहर यूरोप से टकराने लगी थी। 4 मार्च को, उसने पांच सहयोगियों को बात करने के लिए ईमेल किया। मैं चाहता था, वास्तव में, एक विवेक जांच, उसने मुझे बताया। यह अभी तक स्पष्ट नहीं था कि वायरस एक अनियंत्रित महामारी में बदल जाएगा। इटली ने अभी तक लॉक डाउन नहीं किया था। जनजीवन अभी भी सामान्य रूप से चल रहा था। क्या एक अभूतपूर्व राष्ट्रीय निगरानी प्रयास वास्तव में इसके लायक था? वैज्ञानिकों ने नहीं सोचा था कि कोरोनावायरस बहुत तेजी से उत्परिवर्तित होता है। अनुक्रमण को अर्थहीन उत्परिवर्तन के ढेर से ज्यादा कुछ नहीं मिल सकता है।

लेकिन मयूर के सहयोगियों ने सहमति व्यक्त की कि राष्ट्रीय जीनोमिक निगरानी कोशिश करने लायक थी। अनुक्रमण, जो एक साधारण सकारात्मक या नकारात्मक परीक्षण की तुलना में बहुत अधिक जानकारी देता है, कम से कम उन्हें एक विस्तृत रूप दे सकता है कि वायरस कैसे फैलता है।

पढ़ें: कोरोनावायरस वेरिएंट के खिलाफ बेबसी से दूर है शरीर

जरूरी नहीं कि कंसोर्टियम वेरिएंट की तलाश में निकल पड़े। वेरिएंट एक सैद्धांतिक संभावना थी, लेकिन कोई नहीं जानता था कि वे कब और कहां उत्पन्न हो सकते हैं। इसलिए शुरू में, शोधकर्ताओं को इस बात में अधिक दिलचस्पी थी कि देश में कोरोनोवायरस कैसे हो रहा था - मोटे तौर पर अन्य यूरोपीय देशों जैसे इटली, स्पेन और फ्रांस के माध्यम से, सीधे चीन से नहीं, यह पता चला है। और वे इस बात में रुचि रखते थे कि वायरस कैसे फैल रहा है, बड़े और छोटे तरीकों से। एक अध्ययन छह डायलिसिस रोगियों के बीच एक COVID-19 क्लस्टर मिला, जिनकी सभी को सप्ताह के एक ही दिन नियुक्तियां थीं। उनके वायरस बहुत समान थे, लेकिन अस्पताल में कहीं और घूमने वाले वंश से अलग थे, जिसने सुझाव दिया कि ये डायलिसिस रोगी सभी एक ही तरह से संक्रमित थे - या तो डायलिसिस के दौरान या अस्पताल में साझा परिवहन के दौरान। महत्वपूर्ण रूप से, अस्पताल में कहीं और से संचरण को खारिज करके, अधिकारी गंभीर कंबल नीतियों को जारी करने के बजाय अंतर्निहित समस्या को लक्षित कर सकते हैं। अस्पताल ने डायलिसिस प्रतीक्षा कक्ष को बंद कर दिया, रोगियों को अधिक फैलाया, और परिवहन के दौरान सार्वभौमिक मास्किंग लागू की।

जैक रयान के बारे में क्या है

लेकिन जैसे-जैसे मामलों की संख्या आसमान छूती गई, देश में वायरस कैसे पहुंच रहा था, यह सवाल एक तरह से विवादास्पद हो गया। वायरस पहले से ही हर जगह था। और अधिक मामलों का मतलब अधिक अनुक्रम-तो, इतने सारे अनुक्रम। हमने कभी इस पैमाने पर अनुक्रमण का उपयोग नहीं किया है, मयूर ने मुझे बताया।

कोई भी मानव संभवत: प्रतिदिन उत्पन्न होने वाले हजारों कोरोनावायरस जीनोमों के माध्यम से परेशान उत्परिवर्तन के संकेत देखने के लिए नहीं जा सकता है। फिर भी कम्प्यूटेशनल उपकरण जीनोम की तुलना करने के लिए सभी उपलब्ध आंकड़ों के वजन के नीचे झुक रहे हैं। वैज्ञानिक अक्सर संबंधित जीनोम को एक विकासवादी पेड़ में शाखाओं के रूप में मैप करते हैं। लेकिन एक निश्चित बिंदु पर, ये पेड़ असहनीय हो जाते हैं। हमारे विश्लेषण उपकरण ऐसा करने के लिए नहीं बनाए गए हैं, एम्मा हॉडक्रॉफ्ट, बर्न विश्वविद्यालय में एक आणविक महामारी विज्ञानी और एक सह-डेवलपर कहते हैं नेक्स्टस्ट्रेन , एक ओपन-सोर्स प्रोजेक्ट जो रोगजनक अनुक्रमों की कल्पना करता है। टिप जिसने यूके संस्करण की खोज में मदद की, आखिरकार, डी ओलिवेरा से आया, जिसने फ्रंटलाइन डॉक्टरों के सुझाव पर दक्षिण अफ्रीका में नमूनों की एक छोटी, अधिक प्रबंधनीय संख्या का अनुक्रम किया।

जीनोमिक निगरानी की सफलता के लिए डॉक्टरों, सार्वजनिक स्वास्थ्य अधिकारियों और अनुक्रमण प्रयोगशालाओं के बीच एक कड़ी कड़ी महत्वपूर्ण है। डॉक्टर और सार्वजनिक-स्वास्थ्य अधिकारी इस आधार पर रुझानों को नोटिस कर सकते हैं जो जीनोमिस्ट को टिप देते हैं, जो बदले में उत्परिवर्तन का पता लगा सकते हैं जो नई नीतियों के लिए मामला बनाते हैं। लेकिन जरूरी नहीं कि ये दुनिया एक-दूसरे से बात करने की अभ्यस्त हो। और जिन पेड़ों को जीनोमिक-निगरानी विशेषज्ञ संबंधित जीनोम की कल्पना के लिए पसंद करते हैं, उनकी व्याख्या करना कठिन है, क्योंकि अपूर्ण नमूने का मतलब है कि पूरी शाखाएं गायब हैं।

वास्तव में, विशेषज्ञों को भी डेटा की व्याख्या करने में परेशानी हुई है। पिछले फरवरी में, वाशिंगटन राज्य के वैज्ञानिकों ने पहली बार पता लगाया था स्थानीय संचरण का मामला सीओवीआईडी ​​​​-19, जिसे उन्होंने माना, इसके वायरल अनुक्रम से, एक ऐसे व्यक्ति के मामले से उतरा, जो छह सप्ताह पहले चीन से लौटा था। इससे पता चलता है कि वाशिंगटन में एक महीने से अधिक समय से वायरस चुपचाप फैल रहा था। यह एक प्रमुख वेक-अप कॉल था। परंतु जैसे अतिरिक्त अनुक्रमण लापता शाखाओं में भर गया है, उन शुरुआती दिनों की एक अधिक पूर्ण और अलग-तस्वीर उभर कर आया है . सबसे अधिक संभावना है, दूसरा मामला पहले से नहीं उतरा था। COVID-19 का एक अलग परिचय संभावित रूप से वाशिंगटन की स्थानीय ट्रांसमिशन श्रृंखला को वरीयता देता है।

यह अभी भी छोटे पैमाने पर भी एक चुनौती है, जैसे कि जब कोई अस्पताल अपने प्रकोप की उत्पत्ति को इंगित करने का प्रयास करता है। परिदृश्य ए, जिसमें कर्मचारी कॉफी ब्रेक पर एक दूसरे को संक्रमित कर रहे हैं, परिदृश्य बी की तुलना में विभिन्न हस्तक्षेपों की आवश्यकता होती है, जिसमें एक विशेष वार्ड में कई रोगी कर्मचारियों को वायरस पास कर रहे हैं। यूनिवर्सिटी कॉलेज लंदन के वायरोलॉजिस्ट ब्रेउर आगे चल रहे हैं सीओजी-यूके अध्ययन यह देखने के लिए कि क्या जीनोमिक निगरानी वास्तव में अस्पतालों को संक्रमण नियंत्रण में खामियों की पहचान करने और उन्हें ठीक करने में मदद कर सकती है।

कच्चे वायरल सीक्वेंस या पेड़ अस्पतालों के लिए काफी बेकार हैं, हालांकि; उनकी टीम ने इसके बजाय स्वचालित रिपोर्ट तैयार की है जो डेटा को इस संभावना में बदल देती है कि एक मामला उसी अस्पताल में दूसरों से संबंधित है। इन रिपोर्टों को सही होने में कुछ समय लगा है, ब्रेउर स्वीकार करते हैं, और वे अभी भी बेहतर हो सकते हैं। इस बीच, अस्पताल खुद यह पता लगा रहे हैं कि इस नई डेटा स्ट्रीम को अपनी नीतियों में कैसे एकीकृत किया जाए। यह तब और भी मुश्किल हो जाता है जब वे महामारी के प्रकोप से निपटने की कोशिश में व्यस्त रहते हैं। जब आप मामलों से अभिभूत हो जाते हैं, तो टीमों के लिए डेटा देखना बहुत कठिन हो जाता है, वह कहती हैं। रिपोर्ट कम उपयोगी हो जाती है, क्योंकि लोगों के पास उन्हें देखने का समय नहीं होता है।

यह व्यावहारिक समस्या है कि इस महामारी के दौरान जीनोमिक निगरानी बार-बार चली है। वैज्ञानिक जितना चाहें उतना डेटा उत्पन्न कर सकते हैं, लेकिन जनता को उस जानकारी पर कार्रवाई करने के लिए एक पूरी तरह से अलग चुनौती है।

जब यूके और दक्षिण अफ्रीका ने नए रूपों के बारे में अलार्म बजाया, तो दुनिया भर के देशों ने मौलिक रूप से अलग-अलग तरीके से प्रतिक्रिया व्यक्त की।

स्पेक्ट्रम के एक छोर पर, डेनमार्क ने उन्हें बहुत गंभीरता से लिया है। यह देश में लगभग हर सकारात्मक नमूने को अनुक्रमित करने का प्रयास कर रहा है, एक मजबूत राष्ट्रीय निगरानी कार्यक्रम के लिए धन्यवाद जो इसकी राष्ट्रीय स्वास्थ्य देखभाल प्रणाली में प्लग करता है। यह वास्तव में एक बहुत बड़ा लाभ है। हमारे पास चार या पांच बड़े अस्पताल हैं, और एक बार जब आप उनसे संपर्क कर लेते हैं, तो आपके पास मूल रूप से डेनमार्क में सब कुछ होता है, एल्बोर्ग विश्वविद्यालय के एक माइक्रोबायोलॉजिस्ट मैड्स अल्बर्ट्सन कहते हैं, जिन्होंने COVID-19 अनुक्रमण के लिए अपनी प्रयोगशाला को फिर से कॉन्फ़िगर किया है। दिसंबर के बाद से, डेनमार्क यूके संस्करण, बी.1.1.7, के अनुपात को देख रहा है। इसके अनुक्रमण डेटा में लगातार वृद्धि .

नतीजतन, देश ने एक सख्त लॉकडाउन लागू किया, भले ही दिसंबर से कुल COVID-19 मामलों में गिरावट आई हो। दुकानें बंद रहीं, जैसा कि पाँचवीं कक्षा और उससे अधिक उम्र के स्कूलों के लिए था। इकट्ठा होने की अनुमति देने वाले लोगों की संख्या 10 से घटाकर पांच कर दी गई। अगर हमारे पास बी.1.1.7 पर नंबर नहीं होते, तो हम समाज को और अधिक खोलते, अल्बर्ट्सन कहते हैं। केवल डेनमार्क 1 मार्च को कुछ प्रतिबंधों में ढील देना शुरू किया धीमी, परिकलित पुन: खोलने के भाग के रूप में। देश में अभी भी यूरोप में सबसे कम संक्रमण दर है। मुझे बहुत खुशी है कि सरकार मेरे द्वारा वेरिएंट पर जेनरेट किए गए डेटा का उपयोग कर रही है, अल्बर्ट्सन ने मुझे बताया। लेकिन यह थोड़ा डरावना भी है कि उन्होंने हमारे कंधों पर इतना कुछ डाल दिया। जीनोमिक्स पहले कभी भी उन आंकड़ों के लिए जिम्मेदार नहीं रहा है जो पूरे देश के खुलने और बंद होने को नियंत्रित करते हैं।

पढ़ें: जल्द ही हमारी हकीकत बन जाएगी कोरोनावायरस रीइन्फेक्शन

एक को अलग-अलग भाषाओं में कैसे बोलें

संयुक्त राज्य अमेरिका ने वेरिएंट के लिए बहुत अधिक अभावग्रस्त दृष्टिकोण अपनाया है। जब मैंने स्क्रिप्स रिसर्च के माइक्रोबायोलॉजिस्ट एंडरसन से पूछा कि क्या यू.एस. जीनोमिक-निगरानी जानकारी पर काम कर रहा है, तो उन्होंने स्पष्ट रूप से उत्तर दिया, नहीं, हम नहीं हैं। (एंडरसन, जो डेनमार्क से हैं, डेनिश सरकार को भी सलाह दे रहे हैं।) उन्होंने बताया कि महामारी में एक ही समस्या बार-बार सामने आई है: यू.एस. यह योजना बनाने में असमर्थ है कि यदि वेरिएंट प्रमुख हो जाते हैं तो क्या होगा; हम केवल उस पर प्रतिक्रिया करते हैं जो अभी हो रहा है। B.1.1.7 के बढ़ते अनुपात वाले राज्य, जैसे कि फ़्लोरिडा, डेनमार्क की तरह नए प्रतिबंध नहीं लगा रहे हैं। और पिछले हफ्ते टेक्सास और मिसिसिपी ने अपने मुखौटा जनादेश को वापस ले लिया।

महामारी प्रतिक्रिया के अन्य हिस्सों की तरह, यू.एस. में अनुक्रमण अत्यंत टुकड़े-टुकड़े किया गया है। एंडरसन सैन डिएगो में सार्वजनिक-स्वास्थ्य विभाग के साथ काम कर रहे हैं, जहां वे सभी पुष्ट मामलों में से लगभग 2 प्रतिशत का अनुक्रमण कर रहे हैं - यूके या डेनमार्क की तुलना में एक छोटा सा अंश लेकिन अमेरिका के बाकी हिस्सों की तुलना में सभ्य किसी भी क्षेत्र में अच्छा कवरेज अमेरिका शायद किसी खास वैज्ञानिक या लैब की इच्छाशक्ति की वजह से है।

मिशिगन विश्वविद्यालय में, एडम लॉरिंग ने मुझे बताया कि वह व्यक्तिगत रूप से इधर-उधर गाड़ी चला रहा है, परीक्षण प्रयोगशालाओं से नमूने एकत्र करके उन्हें अनुक्रमण मशीनों तक पहुंचा रहा है। यह परिसर में COVID-19 को ट्रैक करने के प्रयास का एक हिस्सा है, और विश्वविद्यालय के छात्र एथलीटों के बीच B.1.1.7 की खोज ने एक को प्रेरित किया दो सप्ताह का निलंबन खेल कार्यक्रम के । लुइसियाना स्टेट यूनिवर्सिटी में, जेरेमी कामिल ने विश्वविद्यालय के कुलपति को बोर्ड पर लाने और वित्त पोषण के विभिन्न स्रोतों को एक साथ मिलाने के बाद लगभग 2,000 जीनोम का अनुक्रम किया है। जरूरी नहीं कि डेटा का खजाना सार्वजनिक-स्वास्थ्य नीति में तब्दील हो जाए। उदाहरण के लिए, कामिल कहते हैं, अगर उन्हें COVID-19 के कई अलग-अलग परिचय के साथ एक नर्सिंग होम मिल जाता है, तो उनके पास इसके संक्रमण-नियंत्रण उपायों को बढ़ाने के लिए सुविधा को बताने का कोई तरीका नहीं है। अनुक्रमण पहले सार्वजनिक-स्वास्थ्य टूलकिट का हिस्सा नहीं रहा है। सार्वजनिक-स्वास्थ्य अधिकारियों को नहीं पता था कि हम क्या करते हैं, और यह कैसे उपयोगी होगा, और डेटा पर कैसे कार्य किया जा सकता है, एक माइक्रोबायोलॉजिस्ट वॉन कूपर कहते हैं, जो एक पिट्सबर्ग में अनुक्रमण सुविधा जो कामिल के सैंपल को प्रोसेस करता है। यह आलोचना नहीं है। यह अभी भी नई तकनीक है।

अलास्का एक ऐसा राज्य है जहां स्वास्थ्य विभाग ने अनुक्रमण को प्राथमिकता दी है, लेकिन डॉक्टरों और अस्पतालों को नमूने भेजने में मुश्किल हो रही है। राज्य के प्रयोगशाला प्रबंधक जयमे पार्कर कहते हैं, प्रदाता जानना चाहते हैं कि उनके लिए इसमें क्या है। और जवाब, दुर्भाग्य से, बहुत कुछ नहीं है। पार्कर औपचारिक रूप से डॉक्टरों को यह नहीं बता सकतीं कि क्या उनका रोगी किसी एक प्रकार से संक्रमित था, क्योंकि उसकी प्रयोगशाला में नैदानिक ​​प्रमाणन का अभाव है। और अगर वह कर भी सकती थी, तो डॉक्टर जानकारी के साथ बहुत कुछ नहीं कर सकते; यह COVID-19 के लिए उपचार नहीं बदलता है। (एक अपवाद यह है कि मोनोक्लोनल-एंटीबॉडी थेरेपी हो सकती है कम प्रभावी ब्राजील और दक्षिण अफ्रीका के वेरिएंट के खिलाफ, हालांकि वे अभी भी यू.एस. में दुर्लभ हैं, और एंटीबॉडी-थेरेपी का उपयोग भी कम है।) जब विभाग को नमूने मिलते हैं, तो वे विभिन्न कंटेनरों में विभिन्न प्रकार के मीडिया में विभिन्न प्रकार के स्वैब पर आते हैं। उन्हें बैच अनुक्रमण के लिए तैयार करने के लिए बहुत सारी हैंडलिंग आवश्यक है। वह कहती हैं कि शुरुआत में, मुझे याद है कि मूत्र के कपों में खारा होता है, जिसमें एक स्वाब होता है। यह बहुत अनियंत्रित हो गया। डेनमार्क में, इसके विपरीत, अल्बर्ट्सन ने मुझे बताया कि परीक्षण प्रयोगशालाएं सभी सकारात्मक नमूनों को 96 छोटे कुओं के साथ साफ-सुथरी प्लेटों में समेकित करती हैं, जो जाने के लिए काफी तैयार हैं।

जीनोमिक निगरानी, ​​पार्कर बताते हैं, जनसंख्या स्तर पर उपयोगी है, लेकिन इसके लिए लोगों को व्यक्तिगत स्तर पर पिच करने के लिए राजी करना आवश्यक है। यू.एस. की खंडित स्वास्थ्य-देखभाल और सार्वजनिक-स्वास्थ्य प्रणालियों के साथ, इसका अर्थ है अनगिनत व्यक्तिगत बिंदुओं को जोड़ना: भौतिक रूप से नमूनों को सही प्रयोगशाला में लाना, सभी कानूनी और नैतिक कागजी कार्रवाई को छांटना, और फिर जनता के लिए परिणामों की व्याख्या करना। उन बिंदुओं को जोड़ने में जितना अधिक समय लगता है, अनुक्रमण पाइपलाइन के माध्यम से एक नमूना प्राप्त करने में उतना ही अधिक समय लगता है। यदि अधिकारी बी.1.1.7 के प्रसार पर डेटा नहीं देख रहे हैं, जैसे कि, एक मरीज के पहली बार वैरिएंट को पकड़ने के एक महीने बाद, यह सीमित करता है कि वे कितनी जल्दी एक प्रतिक्रिया दर्जी कर सकते हैं। यदि वे दिनों के भीतर अनुक्रम करते हैं, तो वे सैद्धांतिक रूप से बी.1.1.7 रोगी के ट्रेसिंग को प्राथमिकता दे सकते हैं संस्करण को धीमा करने के लिए संपर्क . लेकिन जीनोमिक निगरानी जितनी धीमी है, यह सार्वजनिक स्वास्थ्य के लिए उतनी ही कम उपयोगी है। किसी बिंदु पर, यह फिर से अकादमिक हो जाता है।

इसके अलावा, अनुक्रमण डेटा केवल तभी उपयोगी होते हैं जब महामारी विज्ञान डेटा से जुड़ा हो। यह पता लगाने के लिए कि क्या वेरिएंट फैल रहे हैं या अधिक गंभीर बीमारी पैदा कर रहे हैं, आपको यह भी जानना होगा कि लोग कब बीमार हुए, वे कहां हैं, वे कितने बीमार हुए और समय के साथ ये पैटर्न कैसे बदलते हैं। यू.एस. में हाल के सप्ताहों में, वैज्ञानिकों ने कई रूपों का पता लगाया कैलिफ़ोर्निया, न्यूयॉर्क और लुइसियाना में संभावित रूप से चिंताजनक उत्परिवर्तन के साथ, लेकिन उनके पास यह आकलन करने के लिए संदर्भ की कमी है कि क्या वे वास्तविक खतरे हैं। यूके और दक्षिण अफ्रीका अपनी व्यवस्थित निगरानी प्रणाली के कारण अपने वेरिएंट के महत्व को इतनी जल्दी समझने में सक्षम थे।

हाल ही में, सीडीसी ने अपने राष्ट्रीय जीनोमिक-निगरानी प्रयास को तेज करना शुरू कर दिया है। इसने जोड़ा है ठेके हेलिक्स जैसी राष्ट्रीय परीक्षण कंपनियों के साथ। और पिछले महीने, बिडेन प्रशासन ने घोषणा की 0 मिलियन सीडीसी के अनुक्रमण प्रयासों के लिए डाउन पेमेंट के रूप में। एंडरसन ने कहा कि उन्हें उम्मीद है कि यू.एस. को राष्ट्रीय स्तर पर सभी सकारात्मकताओं का 2 प्रतिशत अनुक्रमित करना होगा, जिसमें सेंटीनेल साइटों के नेटवर्क के साथ कुछ स्थानों में उच्च मात्रा में अनुक्रम हो सकता है।

पहली बार इस बुनियादी ढांचे का निर्माण कठिन है; इसे मक्खी पर बनाना, और भी बहुत कुछ। जब अगला महामारी वायरस हमला करता है, हालांकि, जीनोमिक निगरानी जाने के लिए तैयार हो सकती है - इतना तैयार कि अगला वायरस जल्दी से COVID-19 को अब तक के सबसे अनुक्रमित वायरस से आगे निकल सकता है। या इससे भी बेहतर, वायरस समाहित हो जाएगा, और हमारे पास एक वर्ष में फिर से 700,000 जीनोम अनुक्रमित करने के लिए पर्याप्त मामले नहीं होंगे।